Қатерлі ісіктерді емдеу деректердің бас айналуына байланысты: бұлтта оның сұрыпталуы мынада.

Қатерлі ісікке шалдыққан науқастар мен олардың дәрігерлері ауру және оны емдеу туралы бұрын-соңды болмаған ақпаратқа ие және қол жетімді ақпарат бас айналу жылдамдығымен өсуде. Бұл ақпараттың бәрі, егер адамдар мұның барлығын түсіне алмаса, пайдалы емес. 

Мысалы, компьютерлік томография (КТ) кескінін шығаратын скринингтік бағдарлама арқылы ерте диагноз қоюы мүмкін өкпе рагы бар науқас туралы ойланыңыз. Олардың диагностикасы мен емдеу жоспары ілгерілеген сайын олардың қамқоршылары MR және молекулалық бейнелеу, барған сайын цифрланатын патология деректері және геномикалық ақпарат сияқты деректер көздерін әкеледі. 

«Осының бәрі, шынын айтсам, емдеу тобының өздері үшін өте қиын мәселе, өйткені олар осы пациенттерге қалай жақсы күтім жасау және емдеу туралы ойлайды», - деді Луис Кулот, Philips геномика және онкологиялық информатика жөніндегі генерал-майоры Amazon-да. Денсаулық саласына арналған Web Services виртуалды оқиғасы. 

«Қазір онкологияда немесе кез келген медициналық пәнде бұл маңызды, өйткені емдеу маңызды, араласу маңызды», - деді Кулот. «Біз деректерді деректер үшін ғана қаламаймыз. Қамқорлық тобының мүшелері ақпарат негізінде қандай әрекет жасай алады?»

Осы деректердің барлығын жақсырақ меңгеру үшін инноваторлар өмірді сақтап қалуы мүмкін нәтижелер беретін бұлттық есептеулер және машиналық оқыту сияқты құралдарға жүгінді. Осы аптадағы AWS іс-шарасында Кулот Philips компаниясының Техас университетіндегі MD Андерсон онкологиялық орталығымен серіктестігін аралады, оның мақсаты дәрігерлерге пациенттерге арналған жеке күтім жоспарларын жасау үшін олардың барлық деректерін біріктіруге көмектесу. 

Сатнам Алаг, Grail компаниясының бағдарламалық қамтамасыз ету инженериясының вице-президенті, оның компаниясы бұлтты және машиналық оқытуды пациенттерді бір уақытта емес, бірден оншақты түрлі ісік түрлерін тексере алатын жүйені жасау үшін қалай қолданатынын түсіндірді. 

Жақсартылған қатерлі ісік скринингтері мен емдеудің әсерін асыра айту қиын. Алаг атап өткендей, 2020 жылы дүние жүзінде 19 миллионнан астам қатерлі ісік ауруы тіркеліп, 10 миллионға жуық адам қайтыс болды. Әрбір үшінші ер адам және әрбір төртінші әйел өмір бойы қатерлі ісікке шалдығады деген болжам бар.

«Маған немесе отбасы мүшелеріне қатерлі ісік диагнозы қойыла ма? Ол менің денемнің қай жерінде? Оны емдеуге болады ма? Әлде мені өлтіреді ме? Бұл біздің көпшілігімізге ортақ сұрақтар», - деді Алаг. 

Бақытымызға орай, біз қатерлі ісік ауруын зерттеу үшін көбірек деректер жинаған сайын, ғалымдар жылдам клипте емдеудің жаңа нұсқаларын әзірлеуде. Молекулалық профильдеудегі жетістіктер ғалымдарға қатерлі ісіктің әртүрлі санаттары мен ішкі санаттарын, сонымен қатар әртүрлі потенциалды емдеу әдістерін анықтауға көмектесті. 2009 жылы АҚШ-тың FDA сегіз ісікке қарсы дәріні мақұлдады, деп атап өтті Кулот. 2020 жылға қарай бұл сан 57-ге дейін өсті. Оның үстіне қазір онкологиялық науқастар үшін ашық 1,500-ге жуық клиникалық сынақтар бар. 

«Жалпы, қазір қатерлі ісік ауруын емдеу үшін қолданылатын жүздеген мүмкін терапия немесе терапия комбинациясы бар», - деді Кулот. «Демек, бізде бұл екі жақты сынақ бар, солай ма? Науқастың жақсы бейнесін алу үшін осы деректерді қалай біріктіреміз? Ал содан кейін бұл көзқараспен ең жақсы емдеу тұрғысынан мұның бәрі нені білдіреді?»

Бұл мәселені шешу үшін MD Андерсон дәрігерлері дәл онкологиялық шешімдерді қолдау (PODS) жүйесін әзірледі — бұл дәрігерлерге дәрі-дәрмектің дамуы мен клиникалық сынақтардағы соңғы жаңалықтар, сондай-ақ емделушінің емделуге жауаптары сияқты маңызды ақпаратты бағалауға көмектесетін дәлелді құрал. . Бұл оларға жеке емдеу жоспарларын жасауға көмектеседі.

2020 жылы MD Андерсон жүйені дүние жүзіндегі дәрігерлер мен тәжірибешілерге қолжетімді ету үшін Philips және AWS компанияларымен серіктес болды. 

Жүйе тек бұлтта болуы мүмкін, деп атап өтті Кулот, бірқатар себептерге байланысты. Сақтау үшін орасан зор деректер көлемі және орын алуы керек деректерді өңдеудің үлкен көлемі бар. Сонымен қатар, жүйе бүкіл әлемдегі тәжірибешілер үшін қауіпсіз және үйлесімді көп жалға алушы жүйе болуы керек. 

Ең маңыздысы, бұлт дәрігерлерге бірлесіп жұмыс істеуге және олардың деректерін біріктіруге мүмкіндік беру арқылы шын мәнінде жекелендірілген емдеу жоспарларын жасауға мүмкіндік береді, деп атап өтті Кулот. 

«Адамдар қатерлі ісік туралы үлкен деректер мәселесі ретінде айтады, бірақ мен оны кішігірім проблема деп атаймын», - деді Кулот. Ол спецификалық мутациялары бар 4-ші сатыдағы өкпе ісігі бар екенін білетін өкпе обыры бар науқастың мысалын келтірді. 

«Сіз бұл популяцияларды біріктіріп, топтастыруды аяқтайсыз, сондықтан ең үлкен денсаулық сақтау мекемелерінде кейде біз үйренуге тырысатын критерийлерге сәйкес келетін бірнеше пациенттер ғана болады», - деді ол. «Деректерді сәйкестендірілген түрде біріктіру мүмкіндігі - біз одан сабақ алу үшін бұлтқа негізделген экожүйелер арқылы қосылады».

Сол сияқты, Грейлден келген Сатнам Алаг бұлт компанияның қатерлі ісіктерді ерте анықтау сынағы Galleri әзірлеу үшін өте маңызды екенін айтты. Сынақ қатерлі ісіктің 50-ден астам түрін анықтауға арналған, бір реттік скринингтік сынақтарға қосымша ретінде.

«Геномика мен машиналық оқытудың күшін пайдалану көп есептеуді қажет етеді», - деді Алаг. «Деректердің өте үлкен көлемін жинау және масштабтау қажет». 

Бір рет қан алудан бастап, Galleri сынағы пациенттің қанындағы ДНҚ бөліктерін талдау үшін ДНҚ секвенциясы мен машиналық оқыту алгоритмдерін пайдаланады. Сынақ ісіктер қанға бөлінетін жасушасыз нуклеин қышқылдарын (cfDNA) іздейді, бұл сізге денеде қандай қатерлі ісік бар екенін және оның қайдан пайда болғанын айта алады. 

«Тек жеке ісіктерді скринингтен өткізудің орнына, біз адамдарды қатерлі ісікке скринингтен өткізуіміз керек», - деді Алаг. «Бұл соңғы 20 жылда болған екі үлкен технологиялық революцияның арқасында мүмкін болды. Біріншіден, геномиканың күші — енді толық ДНҚ-ны ретке келтіруге болады... терабайт деректердің құны бірнеше күн ішінде тиімді. Екіншіден, машиналық оқытудағы инновациялардың үлкен көлемі. Қазір бізде ондаған миллион параметрлері бар күрделі, терең оқыту үлгілерін құра алатын ноу-хау бар».